Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCLAFQ15004 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms