Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPRHQ149N8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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