Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H3Q13889 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms