Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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GTF2H2Q13888 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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GTF2H2Q13888 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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