Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DDX39BQ13838 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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