Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CUL4AQ13619 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CUL4AQ13619 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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