Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CUL3Q13618 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CUL3Q13618 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CUL3Q13618 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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CUL3Q13618 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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CUL3Q13618 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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CUL3Q13618 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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CUL3Q13618 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CUL3Q13618 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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