Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NAE1Q13564 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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