Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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