Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
IKZF1Q13422 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms