Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE3BQ13370 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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