Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AP3B2Q13367 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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