Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRIM28Q13263 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRIM28Q13263 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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