Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUSP4Q13115 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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