Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHAF1BQ13112 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms