Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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MRPL28Q13084 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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MRPL28Q13084 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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MRPL28Q13084 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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