Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSTF3Q12996 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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