Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BNIP1Q12981 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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