Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms