Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COX10Q12887 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
COX10Q12887 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms