Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SMARCB1Q12824 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCB1Q12824 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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