Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXO1Q12778 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXO1Q12778 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 509.6 ms