Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDE4DQ08499 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDE4DQ08499 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms