Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPN11Q06124 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN11Q06124 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms