Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A2Q05940 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms