Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRIN1Q05586 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms