Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PLOD1Q02809 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PLOD1Q02809 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms