Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DSG1Q02413 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DSG1Q02413 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 468.7 ms