Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms