Protein–RNA interactions for Protein: Q01851

POU4F1, POU domain, class 4, transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1Q01851 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU4F1Q01851 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU4F1Q01851 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms