Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms