Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTCQ00610 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTCQ00610 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms