Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDK3Q00526 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDK3Q00526 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms