Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms