Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPS3AP61247 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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