Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTR3P61158 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms