Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTTPP55157 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTTPP55157 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MTTPP55157 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MTTPP55157 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms