Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EFNA3P52797 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EFNA3P52797 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA3P52797 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA3P52797 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA3P52797 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA3P52797 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA3P52797 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA3P52797 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EFNA3P52797 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms