Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CAPZBP47756 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms