Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
XCR1P46094 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms