Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GRIA3P42263 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms