Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL1P40616 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL1P40616 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL1P40616 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL1P40616 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms