Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms