Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HOXA13P31271 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA13P31271 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms