Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP1P30622 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms