Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GCAP28676 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCAP28676 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCAP28676 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCAP28676 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCAP28676 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCAP28676 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCAP28676 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCAP28676 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCAP28676 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCAP28676 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCAP28676 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms