Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HTR1EP28566 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms