Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PSMB4P28070 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB4P28070 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms