Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
HLA-DMAP28067 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
HLA-DMAP28067 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms