Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PSMB9P28065 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PSMB9P28065 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PSMB9P28065 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PSMB9P28065 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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